Грибы играют значительную роль в круговороте веществ, в разложении растительных и
животных остатков, в образовании органического вещества. Сложный процесс разложения
лесной подстилки (листвы и древесины) осуществляется специальной группой шляпочных
грибов — подстилочных сапрофитов.
 

 К ним относятся, например, многие говорушки. 
Многие грибы обладают богатым ферментным аппаратом и способны образовывать ряд 
физиологически активных веществ. Эти свойства грибов широко применяются для различных 
целей: 
  пектиназы — для осветления фруктовых соков; 
  целлюлазы — для переработки сырья, грубых кормов, разрушения остатков бумажных 
  отходов; 
  протеазы — для гидролиза белков; 
  амилазы — для гидролиза крахмала. 

При помощи гриба черной плесени (Aspergilus niger) в промышленном масштабе получают 
лимонную кислоту. Гибберелин, вещество, полученное из грибов родафу-зариум, способствует 
увеличению завязи ягод винограда, ускоряет время зацветания декоративных растений. 
Некоторые грибы паразитируют на насекомых и других грибах. Из них создан препарат 
боверин, применяемый для уничтожения вредных насекомых. Для борьбы с почвенными 
потогенами создан препарат триходермин, состоящий из спор и мицелия гриба триходермы и 
субстрата, на котором гриб выращивался. Не все грибы приносят пользу, среди них 
встречаются и паразиты растений, потери урожая от которых так велики, что борьбой с ними 
занимаются целые учреждения, а с некоторыми — международные организации.

Наука, изучающая болезни растений, вызванные грибами, называется (фитопатология). 
Большой вред грибы наносят лесному хозяйству, поражая растущие деревья. Ими уничтожается 
до 30% заготавливаемой древесины. Грибы портят смазочные масла и другие нефтепродукты, 
оптические изделия, лакокрасочные покрытия, вызывают коррозию металлов. Многие грибы 
вредят здоровью людей и животных (стригущий лишай, парша, дерматиты), поражают 
легкие, особенно у молодняка птиц, в ряде случаев являются причиной хронического 
гайморита, заболеваний глаз человека, различных болезней рыб и т. д. Опасны 
микотоксикозы — заболевания человека и животных, связанные с отравлением пищевых 
продуктов и кормов токсинами грибов. Употребление в пищу зерна, отравленного токсинами 
грибов фузариев, является причиной таких заболеваний людей, как септическая ангина и 
уровская болезнь (связана с нарушением нормального роста костей у детей).

Пищевое же значение грибов огромно. В настоящее время общее количество грибов, ежегодно 
потребляемое населением земного шара, составляет около 5 млн.тонн, из них в лесах 
собирается только 0,6 млн.тонн, остальные выращены на грибоводческих фермах. 
Интенсивное развитие промышленного выращивания съедобных грибов обусловлено рядом 
обстоятельств: 

  во-первых, высокой пищевой ценностью грибов, содержащих значительное количество 
  белков, витаминов, углеводов, минеральных солей и микроэлементов; 
  во-вторых, для культивирования грибов используются субстраты, малопригодные для 
  других целей; 
  в-третьих, посыле сбора грибов субстрат можно использовать и как белковую 
  витаминизированную кормовую добавку, и как отличное удобрение.